2005年，广州市科技活动经费支出总额190亿元，其中用于研究与发展（R&D）经费支出85亿元，分别比上年增长18.8％和25.0％，占地区生产总值的比例分别达3.71％和1.66％。科技进步对工业经济增长的贡献率达50.8％，比上年提高0.5个百分点。全年受理专利申请11012件，比上年增长33.8％，其中发明专利2029件，增长36.8％；专利授权5724件，增长3.4％；签订技术合同2281项，成交金额40.60亿元，成交金额增长79.41％。高新技术产业基地建设与发展取得新突破，国家网络游戏动漫产业发展基地在广州市挂牌，国家生物医药产业基地申报工作取得重大进展。
科技创新平台建设取得较大进展，自主创新基础条件不断完善。广州中科院工业技术研究院于10月揭牌，推动广州市与中国科学院共建工研院进入新阶段，启动部分合作项目。中科院广州生物医药与健康研究院有专业技术人员100余人，与国内外多家研究院所和企业签订多项合作研究协议，向各级政府申报并启动多项科技攻关项目，初步具备开展大规模科研实验的条件。广州LED工业研究开发基地首期投入1.2亿元，生产中心的封装车间正式投产，研发中心场地即将交付使用。广州中间件研究中心初步建立研发队伍。广州清华数字电视工程技术研发中心首期投入3000万元，重点建成数字电视研发和成果转化基地。重视基础条件平台建设。选择广州电科院等7家单位组建市第二批行业工程技术研发中心，首批选择广州大学“市政公用工程实验室”等7个实验室启动市重点实验室培育试点工作。生物种质资源库建设成效显著，广东省首批挂牌的13个省级种质资源库全部设在广州地区。
高新技术产业快速发展，产业集群竞争力增强。全年全市实现高新技术产品产值1867.87亿元，比上年增长25.7％，占全市工业总产值的27.6％。其中，工业高新技术产品产值1787.8亿元，占全市工业总产值的26.4％。新认定高新技术企业152家，新办高新技术企业214家。至年底，全市经认定的高新技术企业873家，新办高新技术企业519家。高新技术企业经济实力增强。已认定高新技术企业，经济规模超过亿元以上124家，其中建兴光电科技（广州）有限公司成为全市首家产值突破100亿元的已认定高新技术企业。是年，有2家高新技术企业在境内外上市，全市共有10家高新技术企业先后在国内外证券市场上市。高新技术产业开发区各园区基础设施与配套服务设施的建设加快。广州科学城、天河软件园、民营科技园等园区建设与发展进入新阶段。是年，广州高新区区域面积被确定为37.34平方公里，高新区全年实现技工贸总收入914.62亿元，比上年增长15.41％，工业总产值617.82亿元，增长11.19％。软件、生物医药、新材料等有一定基础的优势高新技术产业继续巩固和壮大。全年全市软件企业实现技工贸总收入242.1亿元，软件销售收入151.8亿元。至年底，全市经省认定的软件企业620家，软件产品2356个，分别比上年增加158家和459个。生物医药产业自主创新能力和产业竞争力增强。2001～2005年，广州获得国家二类以上新药证书41个，其中一类新药证书6个；获得国家二类以上临床研究批文24个，其中一类新药临床批文9个。纳米技术研发能力增强，产业化进程加快。“纳米技术在铝塑复合管热熔胶中的应用研究”项目，已建成年产5000吨的生产规模，实现销售收入6400多万元。
企业技术创新主体地位进一步增强。推进大中型企业建立工程技术研究开发中心，全年新组建省级工程中心4家，市级工程中心10家。至年底，全市有国家级工程中心13家，省级工程中心35家，市级工程中心32家。提高中小型科技企业技术创新能力。首次设立广州市科技型中小企业技术创新基金，安排资金预算2500万元，支持中小型科技企业进行技术创新。争取国家创新基金支持获得突破，全市有51家企业获得立项支持，获得国家资金支持超过3000万元，立项数和获得资金数均为上年的2.7倍，创历史新高。
运用高新技术改造传统产业成效显著。制造业信息化推进工程顺利通过国家科技部验收。一批制造业信息化关键技术攻关取得突破，取得“广州钢铁股份有限公司物流交易系统”等22项科研成果，形成一批具有自主知识产权的应用软件。该工程的实施有效提升了企业的自主创新能力与综合竞争力。企业新产品平均开发周期缩短30％，生产周期缩短20％，直接成本下降22.3％，年度存货占流动资产比例降低6％，销售费用降低15％，年销售收入增长47.2％，年交税额增长23.8％。都市农业科技示范带建设推进。全年安排各类科技项目14项，项目总投资3131万元，科技项目的实施有效提高农业科技水平，推动区域经济发展，初步形成优质农产品种养技术示范、农业产品加工保鲜、农业高新技术研发等三大功能组团。
科技型企业孵化器网络建设取得新成效。推动主要高新技术产业化基地的孵化机构建设，支持和鼓励各区、县级市建设有自己特色的科技企业孵化器，引导孵化机构加强与高等院校、科研院所的合作，建立与国内外其他企业孵化机构和科技园区的联系。全市科技企业孵化机构发展迅猛，有广州国际企业孵化器、科学城创新基地等20多家孵化机构，孵化面积近80万平方米，孵化面积比上年增长60％，在孵企业近1000家。
科普活动广泛开展。是年，广州市科技活动周开幕式作为全国6个分会场之一，首次与北京主会场进行电视实时互动直播。活动期间，邀请航天英雄杨利伟和一批知名院士作科普报告、专题讲座。全市群众性的科普活动广泛开展，通过科普巡礼展、科技讲座、科技下乡、科普一日游等活动，促进社会公众理解科学、支持科技创新与和谐社会建设。举办“2005广州纳米技术与纳米生物技术国际研讨会”等高层次科技交流活动，营造较好的学术氛围。
科技攻关选取重点进行突破。应对周边国家及国内部分地区发生禽流感疫情，成立市高致病性禽流感综合防控科技攻关小组和协作组；以研究开发诊断试剂、疫苗和药物，不明原因重症肺炎的快速排查及救治等为主攻方向，组织开展一系列科技攻关，部分研究项目已取得初步成果。同时，针对当前群众比较关心的治安、城市水污染、大气污染、公共安全等焦点、难点问题，安排实施科技强警示范、清洁生产、应用清洁能源、消防安全等一批重点科技攻关项目，取得较好效果。
